ImageJ – en programvara för att analysera och bearbeta bildfiler. Programvaran kan effektivt analysera bilden och ta emot detaljerade tekniska data. ImageJ stöder de flesta av de bildformat och har en uppsättning redigeringsverktyg. Mjukvaran gör det möjligt att producera de olika geometriska transformationer, skapa densitets histogram, genomföra 3D-visualisering, utföra logiska och aritmetiska operationer mellan bilder, etc. ImageJ kan samtidigt arbeta med flera bilder, tillämpa olika filter och utföra batch-bearbetning av filer. ImageJ innehåller många plagins som kraftigt utöka funktionerna i programvaran.